Python Job: Bio-informaticien

Job added on

Location

Montreal - Canada

Job type

Full-Time

Python Job Details

Temporaire temps complet (Remplacement de congé de maternité)

Direction des services multidisciplinaires

Affilié à l’Université de Montréal , l’Institut de Cardiologie de Montréal est un centre hospitalier ultraspécialisé en cardiologie consacré aux soins, à la recherche, à l’enseignement, à la prévention, à la réadaptation ainsi qu’à l’évaluation des nouvelles technologies en cardiologie.

MANDAT

L’ICM est à la recherche d’un.e bio-informaticien.ne pour un remplacement de congé de maternité au laboratoire de diagnostic moléculaire. Sous l’autorité scientifique et administrative d’une biochimiste clinique, le.la candidat.e sera responsable de l’analyse des données de séquençage parallèle à haut débit (SPHD, ou Next-generation sequencing (NGS)) ainsi que de la gestion des données, des scripts et des logiciels en lien avec le SPHD. Cette personne devra aussi développer de nouveaux profils d’analyses à partir sur la plateforme technologique NextSeq2000 (Illumina).

PRINCIPALES RESPONSABILITÉS

Traitement/analyse des données SPHD selon les procédures du laboratoire.
Veiller au bon fonctionnement de la plateforme de séquençage (débogage, configuration, mise à jour et validation des logiciels, gestion de données et archivage);
Veiller à la maintenance des scripts de traitement de données sur les serveurs Linux et Windows;
Participer à la conception, au développement, à la validation et à l’implantation de nouvelles technologies au laboratoire;
Participer à l’amélioration continue du laboratoire en proposant des solutions informatiques pertinentes;
Participer à la validation, la maintenance et le débogage des autres plateformes technologiques utilisées dans le laboratoire (extraction d’ADN, PCR, préparation des librairies, etc.);
Contribuer à la mise en production d’autres systèmes informatiques de gestion de données au laboratoire;
Rédiger et maintenir à jour les procédures standards liées au traitement de données.

EXIGENCES

Maîtrise en bio-informatique;
Expérience pratique de travail avec des données SPHD sur les plateformes MiSeq et/ou NextSeq2000;
Expérience pratique de programmation (Python, HTML SQL, JavaScript, React, Django, etc);
Bonne connaissance pratique des environnements Windows et Linux (en mode ligne de commande);
Connaissance des bases de données génétiques publiques;
Connaissances de logiciels pour suivi des modifications de script (ex : git).
Maîtrise du français oral et écrit (test à réussir);
Bonne compréhension de l’anglais de base (test à réussir);
Membre de l’Ordre des chimistes du Québec (OCQ (atout);

COMPÉTENCES RECHERCHÉES

Démontre un grand sens de l’organisation;
Excellentes habiletés de communication;
Facilité à travailler en équipe et à entretenir de bonnes relations interpersonnelles;
Sens développé du service à la clientèle;
Fait preuve d’autonomie dans l’exercice de ses fonctions;
Souci du travail bien fait;
Habileté d’analyse et de synthèse;
Capacité à travailler sous pression et à gérer son stress.

CONDITIONS DE TRAVAIL

Poste temporaire à temps complet de jour (35 heures/semaine);
Rémunération horaire de 27,46$ à 50,39$ selon l’expérience;
Autres conditions de travail selon les normes en vigueur.

L’Institut de cardiologie de Montréal offre une vaste gamme d’avantages visant la santé, le bien-être et la qualité de vie au travail des employés, dont l’accès gratuit au Centre EPIC, aux cabines Recharjme et aux salles de silence, ainsi que divers autres avantages.

POUR SOUMETTRE VOTRE CANDIDATURE

  • Date d’échéance pour postuler : 17 février 2023
  • Cliquez ici ou vous rendre sur www.icm-mhi.org dans l’onglet «carrières» et sélectionnez «offre d’emploi» ou envoyer directement votre candidature à [email protected]
  • Votre lettre de présentation et votre curriculum vitae doivent être combinés en un seul fichier (Word ou PDF) et ce fichier doit être identifié de la façon suivante : Nom_Prénom (ex : Hamel_Danny).
L’Institut de Cardiologie de Montréal souscrit à un programme d’accès à l’égalité.

Les candidatures des groupes visés (les femmes, les minorités visibles, les minorités ethniques,

les Autochtones et les personnes handicapées) sont encouragées.

Seules les personnes retenues dans le cadre du processus de sélection seront contactées.